全套录音：网状meta实战（检索式、gemtc包操作）+数据库使用&循证统计答疑——沙龙留声机第二期

上周六，meta大神猴哥为大家在线讲解了网状meta分析简介与实战，并现场解答了上一周群友提出的meta循证统计相关问题。

赵老师也在现场回答了以下一系列大数据挖掘相关问题。

发送沙龙到后台，复习上期内容。

现场有一些操作演示，录音+ppt只能还原一部分，本周六继续沙龙，大家尽可能安排时间+良好的网络环境现场收听哦~

发送SL003到后台，马上得全套现场课程录音，跟随两位老师的逻辑，开始小白的历练之路吧~

生信沙龙问答版

问：这里用的是lncrna做GSEA？

答（赵忻艺）：现场录音解答

问：求相关的方案？怎么自己定义gsea的DB文件？

答（赵忻艺）：现场录音解答

问：你好，如果只有两篇芯片数据，做之前公众号推文写的那种meta分析是不是不够啊？那篇公众号是三篇？

答（赵忻艺）：现场录音解答

问：大家好，请问多个GEO数据用metaOmics的metaQC质控前，各个GEO需要如何整理数据？需要筛选出各个GEO的差异基因吗？

答（赵忻艺）：现场录音解答

问：请问tcga下载的数据怎么看里面有多少正常样品和癌症数目？总数已知。

答（赵忻艺）：现场录音解答

问：为什么会出现这种情况呢？

答（赵忻艺）：现场录音解答

网状Meta分析简介与实战ppt 

本次课程的主要内容

1.间接比较简介

2.网状meta分析简介

3.网状meta分析现状

4.网状meta分析gemtc实现

1间接比较简介 

2网状meta分析简介 3网状meta分析现状

猴哥meta沙龙提问版

问：想请问，做meta分析时如果一篇rct某个结局指标只有均数，没有标准差怎么办？但是预实验有个标准差，可以拿过来用吗？

答（猴哥）：现场录音解答

问：请教一个问题。昨天我做基因出现很腻害的异质性，能这么解决么？就是I平方大于50％，P小于0.1。用随机效应模式，最后算出的是P大于0.5，没有统计学意义。然后我今天认真去做了异质性，踢除一篇文章后，就没有异质性了，然后P也小于0.5。

答（猴哥）：现场录音解答

问：大家好，请问多个GEO数据用metaOmics的metaQC质控前，各个GEO需要如何整理数据？需要筛选出各个GEO的差异基因吗？

答（猴哥）：现场录音解答

问：有人知道如果数据不满足正太分布的话，用非正态的时候还能用均值+标准差吗 还是用中位数+95%置信区间或者范围呢

答（猴哥）：现场录音解答

问：相关性meta 把r转换成fisher'z。这个可以不用手动算吗?

答（猴哥）：现场录音解答

问：请问下各位老师，标红的这句应该怎么翻译啊？

答：你这不叫第十五个百分点啊,叫第15百分位,统计学上的事儿

问：这一句呢,第十五个百分位手臂测量？放在里面也不通啊

答：应该就是15百分位的意思，你知道箱型图吧，每个箱子有25百分位，中位数，75百分位。你这个的意思就是低于15百分位数的人群

问：哦哦，但是这一句怎么翻译啊,知道一个词木有用啊

答：bmi小于。。。或arm。。。低于15百分位数的病人？不一定好，你自己再体会下吧

答（猴哥）：现场录音解答

问：有个问题呀，老师，我想问一下，你们做芯片Meta用的是什么R包？

答（猴哥）：现场录音解答

问：还有我搜一个疾病找到很多芯片集，我该怎么选定5-6个进行Meta分析呢？

答（猴哥）：现场录音解答

问：请问诊断性试验可以做网状meta分析吗？比如把诊断方法A、B、C分别与金标准对比的文章纳入同一个网状研究，如果能做，可以推荐一下比较典型的文献吗？

答（猴哥）：现场录音解答

问：对芯片集怎么确定？

答（猴哥）：现场录音解答

沙龙本讲相关资料链接在这里

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GSEA官网网址
http:software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/index.jsp 
 

不得不爱，网状meta分析（三）：R软件gemtc包（点文字直达）

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Meta专栏主编介绍：猴哥，Freescience公众号meta分析专栏目前现任朱彪。副主任医师，武汉大学肿瘤学博士，专注于胃肠道肿瘤分子生物学机制、系统评价/Meta分析、数据挖掘、临床统计研究、